Les thématiques de recherche variées de l’ISEM se structurent au sein de quatre départements scientifiques qui regroupent plusieurs équipes de recherche.
L’Institut des Sciences de l’Evolution de Montpellier (ISEM) (Université de Montpellier, CNRS, IRD, EPHE, CIRAD, INRAP) développe des recherches qui portent sur l’origine et la dynamique de la biodiversité, et sur les modalités et les mécanismes de son évolution.