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Yangfan Feng
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Mon activité
Ma thèse porte sur l’évolution de l’empreinte génomique et des chromosomes sexuels chez les espèces de Silene. Plus précisément, je vise à : i) tester l’hypothèse selon laquelle le conflit sexuel peut favoriser l’évolution d’une empreinte spécifique au sexe ; ii) examiner si l’empreinte génomique contribue à la régulation de l’expression biaisée selon le sexe ; et iii) explorer les mécanismes épigénétiques à l’origine de l’empreinte liée au chromosome X et de la compensation de dosage. Pour répondre à ces questions, j’analyse des données de méthylation de l’ADN, de transcriptome et de modifications des histones, obtenues à partir du séquençage Oxford Nanopore, du RNA-seq et de la technologie CUT&RUN, chez des espèces présentant différents systèmes sexuels (dioïque, monoïque et hermaphrodite). L’objectif général de mon travail est de mieux comprendre le rôle de l’épigénétique dans l’évolution des chromosomes sexuels, en utilisant les espèces de Silene comme système modèle.