Reconstituer l’histoire démographique des populations en utilisant l’ADN est un des défis majeurs en génomique des populations. Cependant, les méthodes actuelles sont peu efficaces pour explorer le passé à l’échelle de dizaines de générations en arrière ainsi que pour éclairer l’histoire d’espèces au cycle de vie complexe, comme c’est le cas des poissons.
C’est dans ce contexte que s’inscrit ma thèse, dont l’objectif est de retracer la démographie passée récente des populations de poissons à l’aide des segments identiques par descendance (IBD).
Mon travail consistera à développer une nouvelle méthode d’inférence démographique à l’aide de simulations, avant de l’appliquer pour retracer l’évolution des effectifs de deux espèces de poissons : le bar européen (Dicentrarchus labrax) et le thon rouge de l’Atlantique (Thunnus thynnus).
Outre l’avancée théorique espérée, mon travail vise également à offrir une nouvelle approche génétique pouvant être utilisée dans le cadre des évaluations de stocks.