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Frédérique Cerqueira

Ingénieur·e d’études
CNRS

Membre de :

Mon activité

Après une quinzaine d’années d’affectation au plateau GenSeq, dont j’ai pu accompagner la dynamique et l’ancrage dans le paysage Montpelliérain, j’ai récemment décidé de faire évoluer mes activités vers plus de développement technique pour répondre aux besoins spécifiques des équipes de recherche de mon unité, tout en assurant la coordination d’un nouveau plateau technique mutualisé de l’Institut des Sciences de l’Evolution, le plateau Biodiversité Moléculaire. Au sein de ce plateau, j’apporte mon expertise en biologie moléculaire aux projets d’équipes en développant des activités de conseil, veille et développement technologique, formation d’étudiants et personnels, encadrement et expérimentation. Au niveau expérimental, j’adapte à la diversité des organismes étudiés les protocoles d’extraction d’ADN ou d’ARN, de dosage qualitatif et quantitatif des acides nucléiques, de génotypage et de préparation de certaines banques Nouvelle Génération de Séquençage (NGS) comme des banques d’ADN génomique ou des banques d’amplicons. Dernièrement, j’ai surtout pu consacrer une partie importante de mon temps à l’adaptation et la mise au point de protocoles novateurs pour le domaine de la biodiversité moléculaire, comme le génotypage KASP (Kompetitive Allele Specific PCR, permettant de génotyper des dizaines de marqueurs sur des milliers d’individus), la construction de banques génomiques à partir d’ADN dégradé (méthode Ovation de NuGEN), la construction ‘maison’ de banques génomiques totales, et enfin, l’haplotagging (une méthode permettant d’accéder au génome complet phasé sur une centaine d’individus).
La coordination de l’activité d’un des trois laboratoires du plateau Biodiversité Moléculaire implique également la réception et distribution des demandes de collaboration en provenance des équipes de recherche, la gestion du planning et des priorités, le dialogue avec les porteurs de projets et la gestion des salles techniques associées.

Mots-clés :

Séquençage – NGS – ADN environnemental – Métagénomique – Génotypage

Responsabilités collectives :

– Co-responsable du plateau Biodiversité Moléculaire de l’ISEM
– Membre élue du Conseil d’Unité de l’ISEM 2021-2026
– Sauveteur Secouriste du Travail – Serre-guide